На главную страницу второго семестра

Данные банка Swiss-Prot о белке IDH_ECOLI(Изоцитрат дегидрогеназа):

Описание поля

Метка поля
(line code)

Значение

Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID IDH_ECOLI
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P08200
Название белка, отражающее его функции DE Isocitrate dehydrogenase [NADP] (EC 1.1.1.42)
(Oxalosuccinate DE decarboxylase) (IDH) (NADP+-specific ICDH) (IDP).
Дата создания документа DT 01-AUG-1998
Дата последнего исправления аннотации DT 01-FEB-2005
Название организма OS Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательности SQ 416 a.о.
Молекулярная масса белка SQ 45757 г/моль
Число публикаций, использованных при создании документа RN 8
Название журнала с самой свежей публикацией RL J. Mol. Biol.(2000).
Описание вторичной структуры FT Содержит информацию о α-спиралях (STRAND) и β-тяжах (HELIX),
а также номера начальных и конечных аминокислотных остатках.
Что содержит поле комментариев? CC
  • Катализируемая реакция (CATALYTIC ACTIVITY ) : 2изоцитрата + НАДф(+)= 2оксоглютарата + 2СO2 +НАДф(H).
  • Характер и количество субъединиц (SUBUNIT): гомодимер.
  • Ферменты, фосфорилируещие белок (PTM): isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase (aceK).
  • Родство (SIMILARITY): Белок имеет сходства с isopropylmalate dehydrogenases семейством.
    • Какие особенности последовательности указаны? FT Содержит информацию о α-спиралей и β-листов, номера их конечных и начальных
    аминокислотных остатков, и их поворотах. А также участок (site), соединяющий белок с лигандом, его название и номер аминокислотного остатка.
    Идентификатор файла PDB DR 1AI2; 1AI3;1BL5;1CW1;1CW4;1CW7;1GRO;1GRP;1HJ6;1IDC;1IDD;1IDE;
    1IDF;1IKA;1ISO;1P8F;1PB1;1PB3;1SJS;3ICD;4ICD;5ICD;6ICD;
    7ICD;8ICD;9ICD.

    Информацию о белке IDH_ECOLI можно получить в банке данных Swiss-Prot, откуда и была взята информация, приведенные здесь.

    Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и IDH_ECOLI:

    Поиск производился с помощью поисковой системы SRS. Для поиска использовалось поле Description; для вывода полученной информации выбирались поля Taxonomy.

    Таксон

    Запрос

    Количество найденных документов

    Археи (Archaea) "(([uniprot-Description:1.1.1.42*] ! [uniprot-Description:Oxalosuccinate decarboxylase*]) & [uniprot-Taxonomy:Archaea*]) 9
    Бактерии (Bacteria) "(([uniprot-Description:1.1.1.42*] ! [uniprot-Description:Oxalosuccinate decarboxylase*]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria*]) 91
    Эукариоты (Eukaryota) "(([uniprot-Description:1.1.1.42*] ! [uniprot-Description:Oxalosuccinate decarboxylase*]) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota*]) 45

    На главную страницу второго семестра

    © Волкова Екатерина,2005